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Sajovitz, AM.
HIV-1 subtypes and transmission of drug resistance in Southern and Eastern Austria
[ Diplomarbeit/Master Thesis ] Graz Medical University; 2010. pp.88.
[OPEN ACCESS]
FullText
- Autor*innen der Med Uni Graz:
- Betreuer*innen:
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Kessler Harald
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- Abstract:
- Hintergrund: In Österreich kann die Mehrheit der analysierten HIV-1 Isolate dem HIV-1 Subtyp B zugeordnet werden. In letzter Zeit könnten Non-B Subtypen migrationsbedingt gehäuft auftreten. Ein erhöhtes Risiko für die Übertragung von therapieresistenten HIV-1 Stämmen wird ebenfalls vermutet.
Studienziele: Die Evaluierung der Prävalenz von HIV-1 Subtypen in Süd- und Ost-Österreich. Die Beurteilung des Auftretens von relevanter HIV-1 Therapieresistenz in unvorbehandelten Patienten. Der Vergleich von Daten innerhalb eines 5-Jahres-Intervalls.
Methoden und Materialien: HIV-1 Sequenzen wurden von 55 unvorbehandelten Patienten 2002 und 55 unvorbehandelten Patienten 2007 bestimmt und miteinander verglichen. Automatische RNA-Extraktion wurde mit dem AmpliPrep instrument (Roche Molecular Diagnostics) durchgeführt. Amplifikation und Sequenzierung wurden unter Befolgung der Gebrauchsanweisung mittels des TruGene HIV-1 Genotyping Kit (SIEMENS medical) durchgeführt. Die Sequenzen wurden mit der GeneLibrarian module of GeneObjects Software (version G12) analysiert. Die HIV-1 Subtypen wurden mittels der geno2pheno database (www.geno2pheno.org) bestimmt.
Resultate: Es stellte sich heraus, dass Subtyp B der vorherrschende Subtyp in 2002 (77.8%) und 2007 (70.4%) war. 2002 wurden zusätzlich die Subtypen CRF01_AE (7.4%), A (5.6%), C, F, G, CRF08_BC, und CRF10_CD (jeweils 1.9%) gefunden. Die Vergleichswerte von 2007 ergaben folgende Subtypen-Prävelenzen: D (9.3%), F (7.4%), CRF02_AG (3.7%), A, G, CRF01_AE, CRF09_cpx, und CRF14_BG (jeweils 1.9%). Die Prävalenz der übertragenen therapieresistenten Stämme betrug 20.4% für jegliches Medikament im Jahr 2002 und 22.2% für jegliches Medikament im Jahr 2007. Der Hauptanteil der primären Resistenzen wurde für die Klasse der Proteaseinhibitoren gefunden. Zweiklassenresistenz wurde bei einem Patient in 2002 und bei 2 Patienten in 2007 entdeckt. Es wurden keine Dreiklassenresistenzen gefunden.
Konklusion: HIV-1 Subtyp B ist noch immer der vorherrschende Subtyp in Süd- und Ost-Österreich. Der Prozentsatz von Non-B Subtypen und rekombinanten Formen ist leicht angestiegen. Die Übertragung von resistentem HIV-1 blieb innerhalb eines 5-Jahres Intervalls stabil.