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Gewählte Publikation:
Hoffer, B.
Isolierung, Charakterisierung und Resistenzerfassung von Escherichia coli Isolaten aus dem Donauwasser.
[ Diplomarbeit/Master Thesis (UNI) ] Universität Graz; 2021.
FullText
- Autor*innen der Med Uni Graz:
- Betreuer*innen:
- Haas Doris
- Zarfel Gernot
- Altmetrics:
- Abstract:
- Im Verlauf der letzten Jahrzehnte konnte ein erhöhtes Ausmaß an antibiotikaresistenten Bakterien im klinischen und landwirtschaftlichen Umfeld beobachtet werden. Ein Grund für diese negative Entwicklung ist der extensive Einsatz von antibiotischen Wirkstoffen in der Human- und Veterinärmedizin. Antibiotikarückstände gelangen beispielweise über Kläranlagen in die Umwelt. Oberflächengewässer wie die Donau bieten ideale Bedingungen für Bakterien, um Antibiotikaresistenzen zu entwickeln bzw. zu stabilisieren. Ziel dieser Diplomarbeit war es, Escherichia coli Isolate aus dem Donauwasser zu untersuchen und deren Antibiotikaresistenz sowie genetische Eigenschaft mittels Polymerasen-Kettenreaktion (PCR) zu erforschen. Die Probennahme fand im Jahr 2019 im Rahmen der Joint Danube Survey 4 (JDS4) Studie statt. Insgesamt wurden 355 E. coli aus Oberflächenwasser (E. coli-OW) von definierten Entnahmepunkten auf Antibiotikaresistenzen untersucht. Dabei zeigten 58,3 % (207/355) der Bakterienisolate keine Resistenz (Wildtyp-Resistenz). 27,9 % (99/355) der untersuchten E. coli-OW Isolate zeigten eine Resistenz gegen eine oder zwei Antibiotikaklassen und 13,8 % (49/355) der E. coli-OW Isolate zeigten ein multiresistentes Verhalten gegenüber den getesteten Antibiotikaklassen. Die am häufigsten beobachteten Resistenzen traten gegen die Antibiotika Ampicillin, Tetracyclin, Amoxicillin/Clavulansäure und Moxifloxacin auf. Bei den Antibiotika Ciprofloxacin und Trimethoprim/Sulfamethoxazol zeigten die untersuchten E. coli-OW Isolate eine Resistenzhäufigkeit von über 10 %. Zehn als ESBL positiv identifizierte E. coli-OW Isolate wurden mittels Polymerase-Kettenreaktion (PCR) auf die ESBL Gene (blaCTX-M1-Gruppe, blaCTX-M9-Gruppe, blaSHV, blaTEM, blaGES) untersucht. Vier Bakterienisolate von E. coli-OW zeigten nach erfolgter Agarose-Gelelektrophorese und Sequenzierung, Resistenzgene aus der TEM-Gruppe, SHV-Gruppe und CTX-M-Gruppe. Es wurden noch nicht alle Probenpunkte von E. coli-OW aus dem Gesamtprojekt der JDS4 untersucht. Deshalb ist anzunehmen, dass es in der statistischen Auswertung noch zu Veränderungen kommt. Aber die bisher erhobenen Daten zum Resistenzverhalten von E. coli-OW zeigen, dass das Donauwasser ein beständiges Reservoir für Bakterien mit erworbenen Resistenzen ist.